Ο κοιμητηριακός ναός της Παναγίας Ζωοδόχου Πηγής στο Καβούσι Ιεράπετρας βρίσκεται στη θέση «Σφακιάς», παραπέμποντας στο ομώνυμο θεομητορικό προσκύνημα της Κωνσταντινούπολης. Είναι μικρός καμαροσκεπής ναός στο εσωτερικού του οποίου διατηρείται σε όχι καλή κατάσταση μικρό μέρος του αρχικού τοιχογραφικού διακόσμου.

Ο ναός της Παναγίας της Κοίμησης βρίσκεται στο παλιό κοιμητήριο κάτω από το χωριό Δρύμισκος της επαρχίας Αγίου Βασιλείου. Η πρόσβαση γίνεται με χωματόδρομο που ξεκινάει από το δρόμο που ενώνει τη Δρύμισκο με την Πρέβελη.

Λίγα μέτρα από την κεντρική πλατεία του χωριού Σταυροχώρι της επαρχίας Ιεράπετρας βρίσκεται ο δίκλιτος ναός του Αγίου Γεωργίου και της Παναγίας. Το νότιο κλίτος διασώζει μέρος των αρχικών τοιχογραφιών που χρονολογούνται από την Ενετική Περίοδο.

Πολύ κοντά στον οικισμό του Ξιδά, που σήμερα ονομάζεται Λύττος προς χάριν της κοντινής αρχαίας Λύττου, βρίσκεται ο ναός του Αγίου Γεωργίου στη θέση Τζενεράληδων (υπάρχει κι ο ναός του Αγίου Γεωργίου μέσα στον αρχαιολογικό χώρο της Λύττου).

Ο ναός της Παναγίας βρίσκεται στο κοιμητήριο πάνω από το χωριό Δρύμισκος της επαρχίας Αγίου Βασιλείου, σε σημείο με εντυπωσιακή θέα στην κοιλάδα των Χελιδονιών. Είναι αφιερωμένος στο Γενέθλιον της Θεοτόκου που εορτάζεται από την Εκκλησία στις 8 Σεπτεμβρίου.

Ο κατάγραφος ναός της Παναγίας της (Μ)πιτσιανής βρίσκεται στην τοποθεσία Καουριανά της μικρής γειτονιάς Κάδρος στο Κακοδίκι Σελίνου και είναι αφιερωμένος στη Γέννηση της Θεοτόκου (εορτ. 8 Σεμπτεμβρίου). Ο ναός είναι μικρός, καμαροσκέπαστος με οξυκόρυφη καμάρα ενισχυμένη με σφενδόνιο και δύο τυφλά αψιδώματα στους πλάγιους τοίχους.

Ο ναός του Αγίου Ιωάννη του Χρυσόστομου βρίσκεται μέσα στον οικισμό της Σαρακήνας Σελίνου. Είναι μικρός μονόχωρος καμαροσκέπαστος και φέρει στο εσωτερικό του τοιχογραφικό διάκοσμο που έχει υποστεί σχεδόν ολοκληρωτική καταστροφή.

Ο ναός του Αγίου Αντωνίου βρίσκεται στην θέση Βρυσίδια, πάνω από την παραλία του Θόλους, στο Καβούσι της επαρχίας Ιεράπετρας. Ο ναός αποτελούσε καθολικό μικρής μονής που τοποθετείται χρονολογικά στα τέλη του 14ου αιώνα. Μάλιστα υπάρχει χάραγμα επισκέπτη που αναφέρει το έτος 1390.

Ο ναός του Σωτήρος Χριστού βρίσκεται στο κοιμητήριο του χωριού Κεφάλι των Εννιά Χωριών Κισάμου και είναι αφιερωμένος στη Μεταμόρφωση του Σωτήρος (εορτ. 6 Αυγούστου). Ο μονόχωρος καμαροσκέπαστος ναός εξωτερικά έχει αλλοιωθεί από νεότερες επεμβάσεις, αλλά εσωτερικά διασώζει πλούσιο τοιχογραφικό διάκοσμο του 1320, σύμφωνα με την κτητορική επιγραφή.

Ο ναός του Αγίου Αθανασίου βρίσκεται λίγο έξω από το Κεφάλι των Εννιά Χωριών της επαρχίας Κισάμου. Ο μονόχωρος καμαροσκέπαστος ναός περιβάλεται από όμορφο πάρκο με πεύκα και εσωτερικά φέρει ενισχυτικό σφενδόνιο.

Ο ναός της Παναγίας στη Σκλαβοπούλα Σελίνου ανήκει στον αρχιτεκτονικό τύπο του μονόχωρου καμαροσκέπαστου και είναι αφιερωμένος στην Κοίμηση της Θεοτόκου. Στο εσωτερικό του φέρει τοιχογραφίες που χρονολογούνται στο πρώτο μισό του 14ου αιώνα και αποδίδονται σε πολύ ικανό αγιογράφο που εισάγει στην Κρήτη τις εξελίξεις της Παλαιολόγειας τεχνοτροπίας.

Ο ναός του Αγίου Ιωάννη του Προδρόμου στο Σέμπρωνα βρίσκεται στην γειτονιά Μπομπολιανά. Είναι μικρός καμαροσκέπαστος μονόχωρος ναός που είναι αφιερωμένος στην Αποτομή της Κεφαλής του Αγίου Ιωάννη (εορτ. 29 Αυγούστου).

Ο ναός του Αγίου Γεωργίου του Κονταρά χρονολογείται τον 11ο-12ο αιώνα και στο εσωτερικό του φέρει τοιχογραφίες της Ενετοκρατίας

Ο ναός της Ζωοδόχου Πηγής βρίσκεται λίγα μέτρα νότια της λίμνης των Δαμανίων και δίπλα στο κοιμητήριο του χωριού. Ο ναός φέρει τοιχογραφίες του 1399 και στην σημερινή του μορφή επανήλθε μετά από αναστήλωση που ξεκίνησε το 1979, καθώς μέχρι τότε ήταν ερειπωμένος.

Στην περιφέρεια του οικισμού Καμηλιανά Σελίνου, κοντά στις Στροβλές, βρίσκεται ο ναός του Μιχαήλ Αρχαγγέλου ή Αστράτηγου. Ο ναός ανήκει στον αρχιτεκτονικό τύπο του μονόχωρου και καμαροσκέπαστου και χρονολογείται στο 1430.

Ο Ναός της Παναγίας στις Λιθίνες Σητείας βρίσκεται στο κέντρο του χωριού. Αποτελείται από τον αρχικό Βυζαντινό ναό της Κοίμησης της Θεοτόκου, που περιέργως τιμάται στο Γενέσιο της Θεοτόκου, στον οποίο προστέθηκαν στα μέσα του 20ου αιώνα δύο ακόμη κλίτη.

Ο ναός της Παναγίας της Μυρτιδιώτισσας βρίσκεται μέσα στα όρια της γειτονιάς Πλεμενιανά της Κανδάνου. Στο εσωτερικό του διασώζονται τοιχογραφίες σε κακή κατάσταση.

Ο ναός των Αγίων Αποστόλων βρίσκεται ανάμεσα στο Κουφαλωτό και την Κάνδανο της επαρχίας Σελίνου. Στο εσωτερικό του διασώζει τοιχογραφίες του 14ου αιώνα σε κακή κατάσταση.

Ο ναός του Αγίου Γεωργίου βρίσκεται λίγα μέτρα βορειοδυτικά του χωριού Πλεμενιανά της επαρχίας Σελίνου. Ο μονόχωρος καμαροσκέπαστος ναός εξωτερικά είναι λιτός, όπως οι περισσότεροι ναοί της επαρχίας, η οποία αποτελεί ένα ζωντανό Βυζαντινό πάρκο.

Ο ναός του Σωτήρος Χριστού βρίσκεται στα Ακούμια Αγίου Βασιλείου και είναι αφιερωμένος στη Μεταμόρφωση του Σωτήρος (6 Αυγούστου). Ο αρχικός μονόχωρος ναός χρονολογείται στον 13ο αιώνα και έχει επεκταθεί μεταγενέστερα προς στα δυτικά, ενώ με τις προσχώσεις πλέον βρίσκεται σε χαμηλότερο επίπεδο από το έδαφος.