Ο Τυφλός Ποταμός βρίσκεται στην επαρχία Κισάμου και το κύριο τμήμα του έχει μήκος περίπου 20 χλμ. Σύμφωνα με τους ντόπιους, η ονομασία του προέρχεται από το γεγονός ότι όταν φουσκώσει, δε «βλέπει» και παρασύρει οτιδήποτε βρεθεί μπροστά του. Το ρέμα έχει νερό ως τις αρχές του καλοκαιριού, ανάλογα πάντα με τις βροχοπτώσεις της χρονιάς.

Ο ποταμός Μουσέλας διαρρέει τις κοιλάδες που σχηματίζονται ανατολικά των Λευκών Ορέων και χύνεται στη μεγάλη παραλία της Επισκοπής, την παραλία με τα περισσότερα ποτάμια στην Κρήτη. Αποτελεί το φυσικό σύνορο των νομών Χανίων και Ρεθύμνου.

Ο Γεροπόταμος Ρεθύμνου είναι μεγάλος ποταμός που εκβάλει στην παραλία του Γεροποτάμου, στο σημείο όπου υπήρχε η αρχαία Αυλώνα, όπου και σχηματίζει σπουδαίο υδροβιότοτο. Το όνομά του σημαίνει «Ιερός Ποταμός», ενώ κοντά στην έξοδό του είναι γνωστός κι ως Αυλοπόταμος λόγω της αρχαίας Αυλώνας. Λίγο πριν την έξοδο στη θάλασσα, ενώνεται με το Μαργαριτιανό Ποταμό ή Μυλοπόταμο.

Ο Γαζανός Ποταμός συγκεντρώνει τα νερά από τις ανατολικές πλαγιές του Ψηλορείτη και αποτελεί έναν από τους σημαντικότερους σε ροή ποταμούς της Κρήτης. Αρχικά συγκεντρώνει τα νερά από τις περιοχές των Ασιτών και του Κρουσώνα και στη συνέχεια ενώνεται με το Γωνιανό ρέμα.

Ο Ληθαίος Ποταμός συγκεντρώνει τα νερά από την λεκάνη της Γέργερης και του Πανασού στις νοτιοανατολικές ρίζες του Ψηλορείτη. Συνεχίζει την πορεία του ως ανοιχτός ποταμός από τα Απομαρμά, κατά τη διάρκεια της οποίας πολλά κάθετα ρυάκια χύνονται στην κοίτη του.

Ο ποταμός Μπούτακας βρίσκεται στην επαρχία Αποκορώνου στα Χανιά πηγάζει από τα νερά των Λευκών Ορέων κοντά στον Βαφέ. Περνάει από το χωριό Βρύσες, όπου υπάρχουν πολλές όμορφες ταβέρνες, κι εκβάλει στην όμορφη παραλία Καλυβάκι στην Γεωργιούπολη, αφού πριν έχει αναμειχθεί με αλμυρό νερό.

Ο υγρότοπος του Αλμυρού βρίσκεται πολύ κοντά στην πόλη του Αγίου Νικολάου, αποτελώντας ένα πραγματικό παράδεισο για την περιοχή. Πρόκειται για μια ελώδη περιοχή 48 στρεμμάτων που τροφοδοτείται μόνιμα με υφάλμυρο νερό από καρστικες πηγές. Η μέση ετήσια παροχή είναι περίπου 2000 λίτρα/δευτερόλεπτο.

Ο ποταμός Κερίτης βρίσκεται κοντά στα Χανιά και ανήκει στα ποτάμια με τη μεγαλύτερη παροχή νερού στην Κρήτη. Συγκεντρώνει τα νερά των Λευκών Ορέων από την περιοχή της Ζούρβας και των Μεσκλών και έπειτα από πορεία που ξεπερνάει τα 25 χλμ καταλήγει στην παραλία του Πλατανιά. Στο διάβα του ενώνεται με πολλά ρέματα και παραπόταμους.

Η πηγή του Αλμυρού θα μπορούσε να είναι ο ορισμός του παράδοξου. Μια πηγή στη βορειοανατολική άκρη του Ψηλορείτη, που απέχει μόλις μερικές εκατοντάδες μέτρα από τη θάλασσα και την πόλη του Ηρακλείου, προσφέρει τη μεγαλύτερη ποσότητα νερού της Κρήτης, κατευθείαν στη θάλασσα μέσω του ομώνυμου ποταμού.

Ο ποταμός Αναποδάρης βρίσκεται στις νοτιοκεντρικές περιοχές του Νομού Ηρακλείου και εκβάλει κοντά στους οικισμούς του Τσούτσουρα και του Κερατόκαμπου. Πιο συγκεκριμένα συγκεντρώνει όλα τα νερά του κεντροανατολικού Νομού Ηρακλείου και μεγάλο μέρος των νερών της νότιας Δείκτης, ενώ τροφοδοτείται από διάφορους παραπόταμους, όπως ο Μπαρίτης ποταμός.

Ο Γεροπόταμος, ο ιερός ποταμός των Μινωιτών (Γέρο-ποταμός σημαίνει ιερός ποταμός) μαζεύει όλα τα νερά της Κάτω Μεσσαράς διασχίζοντας περιφέρειες των αρχαίων πόλεων της Φαιστού και της Γόρτυνας και εκβάλλει στον κόλπο της Μεσσαράς λίγο πιο νότια από τον Κόκκινο Πύργο μέσα στην περιοχή του στρατοπέδου Τυμπακίου. Όλη η περιοχή των εκβολών του δημιουργεί μια σειρά από υγρότοπους μοναδικής ομορφιάς και οικολογικής αξίας.

Ο Ποταμός Αποσελέμης είναι ένας από τους μεγαλύτερους ποταμούς της Κρήτης, ο οποίος δέχεται τα υπόγεια ύδατα του Οροπεδίου Λασιθίου από τις πηγές στις Φλέγες Κασταμονίτσας. Στην συνέχεια διέρχεται κοντά στο χωριό Αβδού, όπου ενώνεται με το ποταμό του φαραγγιού της Αμπέλου και αφού αλλάξει πορεία, περνάει από το χωριό Ποταμιές, όπου υπάρχει ένα μεγάλο φράγμα. Στη συνέχεια, όσο νερό ξεφεύγει από το φράγμα φτάνει στη θέση Ξεροκαμάρες, όπου και ενώνεται με τον μικρό ποταμό των Καρουζανών.

Ο ποταμός Κυλιάρης ξεκινάει κοντά στο χωριό Στύλος Αποκόρωνα και εκβάλει στην παραλία της Κυανής Ακτής, κοντά στις Καλύβες. Το μήκος του είναι 5km και αποτελεί τον δεύτερο μεγαλύτερο ποταμό σε ροή νερού στην Κρήτη. Το όνομα του ποταμού είναι Κυλιάρης, κι όχι Κοιλιάρης όπως θα δείτε σχεδόν παντού, καθώς σύμφωνα με το Δέφνερ προέρχεται από το ρήμα κυλώ. Κυλιάρης είναι ο ποταμός που με την ορμή του κυλάει πέτρες. Κατά την αρχαιότητα ο ποταμός ονομαζόταν Πυκνός επειδή στις όχθες του είχε πυκνούς θάμνους και δέντρα.

Ο Πλατύς Ποταμός είναι ένας από τους μεγαλύτερους ποταμούς της Κρήτης που τροφοδοτείται από τα νερά του βορειοανατολικού Κέδρου και της Κοιλάδας του Αμαρίου. Οι εκβολές του βρίσκονται στην παραλία της Αγίας Γαλήνης στο Νότιο Ρέθυμνο. Ο Πλατύς Ποταμός ανήκει στους Ποταμούς της Κρήτης που έχουν πολύ νερό και πυκνή βλάστηση. Μάλιστα, κατά μήκος του υπάρχουν πανέμορφα πέτρινα γεφύρια με καμάρες που έκτισαν παλιά οι κάτοικοι της περιοχής για να διασχίζουν το ποτάμι.

Ο ποταμός Γιόφυρος ή Διακονιάρης βρίσκεται στα βόρεια του Νομού Ηρακλείου. Ο ποταμός πηγάζει από διάφορους παραπόταμους γύρω από το χωριό Προφήτης Ηλίας και εκβάλει στην παραλία δίπλα από το Παγκρήτιο Στάδιο, στην πόλη του Ηρακλείου.

Η λίμνη και το ποτάμι του Αλμυρού στην περιοχή της Γεωργιούπολης αποτελούν έναν από τους σπουδαιότερους υγροτόπους της δυτικής Κρήτης. Στη λίμνη συναντάμε αγριόπαπιες, νερόκοτες και πολλά άλλα υδρόβια πτηνά. Περιφερειακά της λίμνης δημιουργείται ένας φυσικός φράχτης από υδροχαρή φυτά, αγριοκαλαμιές και καλάμια, μυρτιές, πικροδάφνες και βάτα.

Ο Ακουμιανός ποταμός είναι ο τρίτος σε μέγεθος και ποσότητα νερου της επαρχίας Αγίου Βασιλείου Ρεθύμνου (μετά τον Μέγα Ποταμό και τον Πλατύ ποταμό). Παίρνει το νερό του από δεκάδες πηγές από τις πλαγιές των βουνών Κέδρος και Ασιδέρωτας και έχει ροή νερού όλους τους μήνες του χρόνου, ιδιαίτερα στο πάνω μέρος του.

Ο Περαστικός έχει μεγάλη παροχή όλο το χρόνο και παρά το πολύ μικρό μήκος που έχει που δεν είναι πάνω από πενήντα μέτρα δημιουργεί ένα πολύ σημαντικό υδροβιότοπο. Γύρω από τις πηγές του δημιουργείται ένας πολύ σημαντικός καλαμιώνας όπου βρίσκουν καταφύγιο πολλά υδρόβια πουλιά, έντομα, αμφίβια και χελώνες αλλά και πολλά υδροχαρή φυτά.

Στα Δυτικά του νομού των Χανίων και 20 περίπου χιλιόμετρα από την πόλη των Χανίων συναντάμε τις εκβολές του ποταμού Ταυρωνίτη στο χωριό του Ταυρωνίτη, ο οποίος είναι γνωστός για την μεταλλική γέφυρα που αποτελεί μνημείο για την Μάχη της Κρήτης, όταν και βομβαρδίστηκε.

Ο Ποταμός Μορώνης (ή Πέρα) συγκεντρώνει τα νερά του από την ευρύτερη περιοχή της Σούδας και Βιοτεχνικού Πάρκου Χανίων και τα μεταφέρει στη παραλία της Σούδας. Το συνολικό του μήκος δεν ξεπερνάει τα 5χλμ, αλλά είναι σημαντικός καθώς έχει ροή όλο το χρόνο.