Фандаксоспилиара (также известная как «Пещера с привидениями») находится рядом с каменоломней Латцимас в провинции Ретимно. Пещера изначально была руслом подводной реки, которая в данное время без воды.

Пещера находится к северо-северо-востоку от Като Закроса. До пещеры можно добраться либо пешком от Като Закроса - примерно за час, либо на моторке от пляжа в Като Закросе (20-25 минут) и потом пешком по довольно утомительному подъему (15 минут). Вход поднят на высоту 105 м. Пещера образована известняком верхнего мелового периода и доломитов триасового периода.

Недалеко от области Сфакиа, за деревней Асфендос находится одноименная пещера. Местность называется Скордулакия из-за растения, которое произростает здесь повсюду, вот почему местные жители дали пещере второе название – Скордулакия.

Катсоматадо известна расположенной на высоте 400 метров над уровнем моря пещерой, пещерой Премудрости Божьей , часто также именуемой пещерой Святой Софии. Пещера известна историями и легендами из различных эпох истории острова. Здесь была найдена икона Премудрости Божьей вывезенная критскими солдатами из церкви, построенной Императором Юстинианом в Константинополе. Икона была вывезена отступающими критскими войсками (около 1500 человек) во время захвата Константинополя турками.

Первая разведка пещеры была организована 31 марта 2000 года учёными палеоантропологии и спелеологии при содействии дайвинг –центра Creta. В составе группы погрузился профессиональный дайвер и режиссер Г. Тзанакис. Полученные результаты были фантастическими, так как кроме потрясающей красоты пещеры, были найдены кости слонов.

В окрестностях селения Патсос находится пещера Святого Антония, покровителя детей. Расположено это место на дне небольшого ущелья, по которому протекает маленькая речушка, вернее, ручей. Кругом растут деревья, поэтому там в жару - свежо и прохладно. Есть там и святой источник.

Путь к пещере находится в зеленой природе ,посетитель будет видеть красивые деревни и будут иметь возможность увидеть новую плотину Апоселеми На высоте 760 метров справа от деревни Авду где начинается грунтовая дорога идущая черезгустой лес к монастырям Святого Иоанна и Святой Анны по тропе ведущей вверх подходим к пещере церквушке Святой Фотини.

Недалеко от монастыря Католико находится пещера Св. Иоанна (Иоанниса Эремитиса), в которой святой жил и умер. Сохранилась его каменная лежанка в глубине пещеры. Об этом месте ходит множество легенд. Особенно часто рассказывают, что многие люди чувствуют около лежанки и проходя над пещерой огромный столб чистой энергии. Но чтобы добраться до этого места обязательно нужно иметь фонарики (пещера не освещена, её длина около 150 м), удобную спортивную обувь, неплохо бы прихватить и палку-опору. Сотни паломников стекаются сюда 7 октября, в День св. Иоанна, одного из самых больших религиозных праздников на Крите.

Знаменитая пещера Аркудиотисса расположена 2 км севернее монастыря Гувернето (дальше ущелья Авлаки). Она славится сталагмитом в виде медведя, наклонившегося попить воды. Медведь-сталагмит и послужил причиной такого названия пещеры. Считается, что эта пещера использовалась с древнейших времен для поклонений Аполлону и Артемиде. Праздник богини-медведицы отмечался в месяце гамилион.

Пещера Кумароспилиос находится рядом с Монастырем Гувернето и обладает высокой археологической ценностью. Пещера была обнаружена в 1942 Ю. Янтсеном и в 1972 раскопки возглавил И. Тседакис.

К самым известным пещерам префектуры Ираклион и важнейшим памятникам Крита в целом относятся искусственный пещеры Лабиринта Минотавра и Малого Лабиринта. Раньше, в древнем городе Гортина, это были каменоломни, которые врезались с севера и юга в пологий холм к югу от деревни Морони.

Пещера Лавиринтаки расположена в 50км к югу от Ираклиона, на небольшом холме между Плути и Морони и представляет собой небольшую древнюю каменоломню, с самой большой комнатой в ней в 300 кв. метров, в то время как высота достигает 4м в некоторых местах. Имеется несколько колонн для поддержания свода.

Ущелье Агиофараго находится на юге Крита в области Ираклион, к юго-востоку от поселка Матала. Согласно легенде, триста отшельников жило здесь в полной изоляции друг от друга и встречались они только один раз в год в Goumenospilio. В этот день они собирались в пещере и усаживались на триста камней, пересчитывая сколько камней осталось свободными, так они узнавали сколько их умерло за год.

Пещера Камилари расположена всего в 200м от 13-го км старой дороги между Ираклионом и Ретимно, около Тилиссоса, на высоте 267м над уровнем моря. Длина составляет 200м, в то время как вход имеет ширину 10м и высоту 4м.

Тилиссоская пещера Анонима находится в 16км к западу от Ираклиона, приблизительно за 1км до Вулисмено Алони, на высоте 250 метров. Она была найдена в 2010 во время строительства новой дороги между Аногией и Тилиссосом.

В нескольких метрах к югу от входа в пещеру Чайноспилиос находится вход в пещеру Хамото Спилиари (т.е. Пещера с низким сводом), которая имеет длину 32 метров, ширину 6 метров и высоту 6 метров. Это очень небольшая пещера, но она имеет свой шарм и заслуживает того, чтобы изучить!