Ο ναός του Σωτήρος Χριστού βρίσκεται στο κοιμητήριο του χωριού Κεφάλι των Εννιά Χωριών Κισάμου και είναι αφιερωμένος στη Μεταμόρφωση του Σωτήρος (εορτ. 6 Αυγούστου). Ο μονόχωρος καμαροσκέπαστος ναός εξωτερικά έχει αλλοιωθεί από νεότερες επεμβάσεις, αλλά εσωτερικά διασώζει πλούσιο τοιχογραφικό διάκοσμο του 1320, σύμφωνα με την κτητορική επιγραφή.

Ο ναός του Αγίου Αθανασίου βρίσκεται λίγο έξω από το Κεφάλι των Εννιά Χωριών της επαρχίας Κισάμου. Ο μονόχωρος καμαροσκέπαστος ναός περιβάλεται από όμορφο πάρκο με πεύκα και εσωτερικά φέρει ενισχυτικό σφενδόνιο.

Ο ναός του Αγίου Βασιλείου βρίσκεται βόρεια του χωριού Βαβουλέδω Κισάμου, το οποίο είναι μια από τις πολλές γειτονιές των Παλαιών Ρουμάτων. Ο ναός αποτελεί επέκταση κατά τον 19ο αιώνα, του μικρότερου μονόχωρου καμαροσκέπαστου ναού του Σωτήρος Χριστού, ο οποίος χρονολογείται στον 15ο αιώνα. Οι δύο ναοί επικοινωνούν εσωτερικά με άνοιγμα στο νότιο τοίχο του Σωτήρος Χριστού.

Ο σπηλαιώδης ναός του Οσίου Ιωάννη του Ξένου βρίσκεται στην τοποθεσία Καβούσι, στην περιφέρεια του χωριού Πλάτανος και έχει μοναδική θέα στην εύφορη κοιλάδα της Φαλάσαρνας. Στο χώρο υπάρχει τάφος που σύμφωνα με την παράδοση ενταφιάστηκε ο Άγιος Ιωάννης ο Ξένος ή Ερημίτης, του οποίου τα λείψανα έχουν πλέον μεταφερθεί στην Κέρκυρα και στον Άγιο Κυρ Γιάννη στα Τσουρουνιανά.

Το έρημο χωριό Καναβάς Κισάμου βρίσκεται στην ανατολική πλαγιά του υψώματος Προφήτης Ηλίας και είναι προσβάσιμο μέσω χωματόδρομου που ξεκινάει από τα Ζαχαριανά. Σχεδόν πάνω στην κοίτη του ποταμού που περνάει κάτω από τον οικισμό είναι κτισμένος ο ναός του Αγίου Γεωργίου, που φέρει τοιχογραφίες, σε μια μοναδική τοποθεσία με θεόρατα πλατάνια.

Στη Χερσόνησο Ροδωπού και όχι πολύ μακριά από το ομόνυμο χωριό συναντάμε το οροπέδιο του Αγίου Νικολάου. Ο Άγιος Νικόλαος είναι ένα από τα μεγαλύτερα οροπέδια της χερσονήσου, μικρότερο όμως από αυτό του Γκιώνα, που στο παρελθόν καλλιεργούνταν σε κάθε του μέτρο.

Ο ναός του Αγίου Γεωργίου βρίσκεται στο χωριό Κούνενι (σημερινή Βάθη) και ανήκει στον αρχιτεκτονικό τύπο του μονόχωρου καμαροσκέπαστου. Εσωτερικά ο ναός φέρει τοιχογραφικό διάκοσμο του 1284 από λαϊκό ζωγράφο που ακολουθεί την παράδοση του 12ου αιώνα.

Η μικρή γειτονιά Λατζιανά του χωριού Βουλγάρω Κισάμου αποτέλεσε την έδρα πατριαρχικής μονής αφιερωμένης στην Αγία Βαρβάρα, της οποίας το μεγάλο καθολικό σώζεται σε ερειπιώδη κατάσταση κοντά στο νεότερο ναό της Αγίας Βαρβάρας. Ο παλαιός ναός κτίστηκε περίπου τον 11ο αιώνα στον αρχιτεκτονικό τύπο του σταυροειδούς με τρούλο με μεταγενέστερη προσθήκη νάρθηκα.

Ο ναός του Αγίου Νικολάου βρίσκεται σε αγροτική τοποθεσία βόρεια του χωριού Μουρί της επαρχίας Κισάμου. Ανήκει στον αρχιτεκτονικό τύπο του απλού σταυρεπίστεγου και χρονολογείται στον 13ο αιώνα. Εξωτερικά έχει υποστεί μεγάλες αλλοιώσεις, αλλά ευτυχώς εσωτερικά διασώζει μεγάλο μέρος του τοιχογραφικού διάκοσμου στις τρεις από τις τέσσερις κεραίες που αποδίδεται σε λαϊκότροπο αγιογράφο του 14ου αιώνα.

Ο ναός του Αγίου Ιωάννη του Θεολόγου είναι κτισμένος στον τύπο του μονόχωρου καμαροσκέπαστου με διαστάσεις 11,20 x 4.46 μέτρα. Στοιχεία για την ακριβή του χρονολόγηση δεν σώζονται, αλλά σύμφωνα με την τεχνοτροπική ανάλυση του τοιχογραφικού του διακόσμου, ο ναός ανάγεται στο πρώτο μισό του 14ου αιώνα.

Η μονή Παρθενώνος είναι σύγχρονο γυναικείο μοναστήρι αφιερωμένο στη Ζωοδόχο Πηγή. Ιδρύθηκε το 1905 και ανακαινίστηκε το 1962. Εδώ λειτούργησε η Αστική Σχολή Θηλέων Κισσάμου και η πρώτη σχολή Κωφαλάλων στην Κρήτη.

Η μονή της Παναγίας της Χρυσοσκαλίτισσας βρίσκεται 72km νοτιοδυτικά των Χανίων, πολύ κοντά στην μαγευτική λιμνοθάλασσα του Ελαφονησίου. Είναι μοναστήρι με μορφή φρουρίου, σκαρφαλωμένο σε βράχο 35m με απεριόριστη θέα στη θάλασσα.

Η Μονή της Παναγίας Οδηγήτριας βρίσκεται στη βάση της χερσονήσου της Σπάθας, περίπου 26km δυτικά από τα Χανιά και 2.5km βόρεια από το Κολυμπάρι, δίπλα στην θάλασσα. Η μονή είναι γνωστή κι ως Μονή Κυρίας των Αγγέλων Γωνιάς λόγω της θέσης της στο δυτικό άκρο του κόλπου των Χανίων.

Στη περιοχή Μαραθοκεφάλα στη Σπηλιά Κισάμου, 25 χλμ δυτικά της πόλης των Χανίων και μόλις 3 χλμ από το Κολυμπάρι, σε μια όμορφη βουνοκορφή, βρίσκεται το περίφημο ιστορικό σπήλαιο του Αγίου Ιωάννου του Ερημίτη ή Ξένου. Μέσα στο σπήλαιο υπάρχει ναός του 15ου αιώνα και θεμέλια παλιών κελιών που χρονολογούνται κατά τον 17ο – 18ο αιώνα.

Σε ένα από τα πιο απόμερα σημεία της Κρήτης, στη Χερσόνησο της Γραμβούσας, λειτούργησε η μικρή μονή του Αγίου Ιωάννη που είναι αφιερωμένη στην Αποτομή της Κεφαλής του Τιμίου Προδρόμου. Εκτός από το μικρό ναό, σώζονται ετοιμόρροπα θολωτά κτίρια της μονής.

Η ακατοίκητη σήμερα μονή της Γρας Κεράς στα Δελιανά Κισάμου είναι αφιερωμένη στο Γενέσιο της Θεοτόκου. Το όνομα Γρα Κερά προέρχεται από την Ιερά Κερά (Παναγιά). Η μονή το 1632 έγινε μετόχι της μονής Γωνιάς Οδηγήτριας στο Κολυμπάρι, όπως αναφέρεται σε σχετικό έγγραφο, άρα υπήρχε ήδη.

Στο σημείο αυτό, μέσα σε ένα κατάφυτο περιβάλλον, λειτούργησε μοναστήρι αφιερωμένο στον Τίμιο Σταυρό. Σήμερα η μονή δεν λειτουργεί. Οι εικόνες του ναού ανήκουν στον αγιογράφο Παπαδάκη από τα Ροδωπού (1886) ενώ το τέμπλο χρονολογείται στο στα 1883.

Το μικρό μοναστήρι της Υπαπαντής του Σωτήρος λειτουργούσε σε μια ιδιαίτερη τοποθεσία, στα Χάμπαθα Κισάμου, με μοναδική θέα στις τριγύρω περιοχές. Ο ναός εορτάζει στις 2 Φεβρουαρίου, όταν γίνεται μεγάλο πανηγύρι.

Όταν άρχισαν οι επιδρομές των πειρατών στις θάλασσες της Κρήτης, οι μοναχοί της μονής Αγίου Γεωργίου στις Μένιες αποφάσισαν να μεταφερθούν σε μια πιο ασφαλή τοποθεσία.

Μαζί με τη μονή του Αγίου Ιωάννη στον Γκιώνα, λίγα χιλιόμετρα πριν, ήκμασαν κατά την όψιμη Ενετική κυριαρχία όπου μετά την άλωση της Κρήτης από τους Τούρκους, παραχωρήθηκαν στη μονή της Οδηγήτριας Γωνιάς, η οποία συγκέντρωσε πλήθος μικρών μοναστηριακών συγκροτημάτων ως μετόχια της.