Археологический музей города Агиос-Николаос был основан, чтобы выставлять там экспонаты с востока Крита, которые раньше отправляли в Музей Ираклиона. Экспозиция пока не завершена, однако она охватывает длительный промежуток времени - с эпохи неолита до окончания греко-романского периода.

Археологический музей города Сития впервые открыл свои двери широкой публике в 1984 году - через сто лет после того, как Итальянская археологическая школа провела в этом регионе первые официальные раскопки.

Археологический музей Ханьи расположен в историческом районе Халепа в городе Ханья..

Археологический музей Ретимно был основан в 1887 году Обществом друзей образования. Археологические находки выставлены в музее в зависимости от исторического периода и делятся на следующие коллекции

Археологический музей Киссамос относится 25-ому Департаменту доисторических и классических памятников и расположен в одноимённом прибрежном городе Западного Крита, который был построен на останках античного города Киссамос.

Археологический музей Арханес является не просто обычным провинциальным музеем. Музей Арханес предоставляет нам очень ценную информацию о Минойской цивилизации.

Археологическая коллекция Малевизи представлена более 500 старинных объектов, датируемых всеми эпохами критской античности. Большая часть выставки представлена экспонатами из коллекции Метаксас, поддерживаемой Николаосом Метаксосом с 1959 по 1997.

Небольшой Археологический музей расположен в центре города Иерапетра, на площади Kanoupaki возле ратуши. В здании османской школы Mehtepi, построенной в 1899 году. Сам музей основан в конце XIX века.

Археологическая и фольклорная коллекция Миртоса работает с 2001 и представляет, по большей части, приватную коллекцию Джорджа Димитрианакиса. Археологическая выставка включает в себя несколько находок с археологических раскопок Пиргоса, Фурну Корифи и из других мест региона.