Έξω από το χωριό Φρες, μέσα σε μια λαγκαδιά και στην καταπράσινη τοποθεσία «Κούκου» βρίσκεται χτισμένη η Παναγιά των Δύο βράχων. Κάποτε ένας βράχος ξεκόλλησε από το βουνό και κύλησε στην πλαγιά. Πάνω του χτίστηκε η εκκλησία. Ακριβώς δίπλα βρίσκεται ένα άλλος βράχος όπου όλα μαζί δημιούργησαν ένα εντυπωσιακό σύμπλεγμα.
Η Βυζαντινή εκκλησία του Αγίου Παντελεήμονα που θεωρείται ότι είναι μία από τις παλαιότερες στην Κρήτη είναι κτισμένη σε όμορφο φυσικό περιβάλλον και βρίσκεται 3 χιλιόμετρα περίπου έξω από το Καστέλι Πεδιάδος του νομού Ηρακλείου.
Στον Άη Γιάννη στα Αστερούσια υπάρχει το ομώνυμο μοναστήρι, το οποίο είναι κτισμένο μέσα σε μια σπηλιά και έχει πολύ παλιές τοιχογραφίες (από το 1360). Αγιογραφίες υπάρχουν και στον εξωτερικό τοίχο του ναού, πολύ σπάνιο φαινόμενο στο νησί.
Ο άκρως εντυπωσιακός ναός του Αγίου Φανουρίου στην Κιθαρίδα που χρησιμοποιείται σήμερα ως κοιμητηριακός υπήρξε το καθολικό της ανδρικής μονής της Παναγίας της Ελεούσας. Η μονή ήταν μετόχι της Μονής Αγίας Ειρήνης.
Μαζί με τη μονή του Αγίου Ιωάννη στον Γκιώνα, λίγα χιλιόμετρα πριν, ήκμασαν κατά την όψιμη Ενετική κυριαρχία όπου μετά την άλωση της Κρήτης από τους Τούρκους, παραχωρήθηκαν στη μονή της Οδηγήτριας Γωνιάς, η οποία συγκέντρωσε πλήθος μικρών μοναστηριακών συγκροτημάτων ως μετόχια της.
Ο Άγιος Γεώργιος στην πανέμορφη τοποθεσία Τουπάκι με τα δεκάδες πεύκα, κοντά στην Επισκοπή Πεδιάδος, υπήρξε καθολικό μικρού μοναστηριού που από τον 16ο αιώνα ήταν μετόχι της μονής Αγκαράθου.
Στην κορυφή του ενός από τους δύο λόφους, γνωστούς ως Δύο Αοράκια, δεσπόζει ο ναός των Αγίων Πάντων, ο οποίος ανήκει στην ενορία Καλλιθέας. Παρόλο που φαίνεται ως νεότερος, ο ναός ανήκει στην Ενετική Εποχή και φέρει ελάχιστα ίχνη τοιχογραφιών.
Η εκκλησία του Αγίου Νικολάου στα Κυριακοσέλλια ανήκει στις σημαντικότερες εκκλησίες της Κρήτης καθώς οι τοίχοι της είναι προσεκτικά τοιχογραφημένοι. Αποτελεί ένα από τα καλύτερα παραδείγματα Βυζαντινής αρχιτεκτονικής στο νησί. Είναι πολύ πιθανόν να είναι αφιερωμένος στον Νικόλαο Στουδίτη που καταγόταν από τα Χανιά και όχι στον Άγιο Νικόλαο τον εκ Λυκίας.