Ο ναός του Αγίου Ιωάννη του Θεολόγου βρίσκεται στα όρια του οικισμού Κισσός της επαρχίας Αγίου Βασιλείου και εορτάζει στις 26 Σεπτεμβρίου. Είναι μικρός καμαροσκέπαστος του 13ου αιώνα, με σχετικά μεγάλο ύψος σε σχέση με τις άλλες του διαστάσεις, θεμελιωμένος σε φυσικό βράχο.
Ο ναός των Εισοδίων της Θεοτόκου ή Κάτω Παναγιά βρίσκεται κοντά στο νότιο τμήμα του κάστρου Belvedere και είναι μικρός μονόχωρος ναός με δύο φάσεις. Στην παλαιότερη, πιθανόν του πρώτου μισού του 14ου αιώνα, ανήκει το ανατολικό τμήμα του, το οποίο διασώζει ελάχιστα ίχνη τοιχογραφιών αυτής της περιόδου.
Ο ναός του Τιμίου Σταυρού είναι κτισμένος στην κορυφή εντυπωσιακού βραχώδους λόφου σε υψόμετρο 750μ με εντυπωσιακή θέα στην Ιεράπετρα. Στο εσωτερικό του φέρει μερικές τοιχογραφίες της Ενετοκρατίας.
Ο ναός του Αγίου Γεωργίου στο Ξυλομαχαίρι βρίσκεται ανατολικά της Μονής Πρέβελη, πολύ κοντά στο επιβλητικό φαράγγι του Κουρταλιώτη και στην έξοδο του Φρατιανού Φαραγγιού. Είναι μικρός μονόχωρος καμαροσκέπαστος ναός που χρονολογείται στα μέσα του 13ου αιώνα, ο οποίος αργότερα επεκτάθηκε προς τα δυτικά. Στο εσωτερικό του σώζονται δύο στρώματα τοιχογραφιών, καθώς μετά την επέκταση αγιογραφήθηκε εκ νέου.
Ο ναός της Αγίας Μαρίνας είναι μικρός και μονόχωρος με το εσωτερικό του τοιχογραφημένο από τις αρχές του 14ου αιώνα. Ο εικονογραφικός διάκοσμος σώζεται αποσπασματικά και είναι χαρακτηριστικός λαϊκότροπης τέχνης της εποχής.
Ο μικρός μονόχωρος ναός του Αγίου Γεωργίου στο Κουστογέρακο Σελίνου βρίσκεται στο κοιμητήριο του χωριού. Ο ναός διασώζει τοιχογραφίες του 15ου αιώνα ιστορημένες από τον ζωγράφο Γεώργιο Προβατόπουλο. σύμφωνα με επιγραφή του 1488.
Ο κατάγραφος ναός του Μιχαήλ Αρχαγγέλου βρίσκεται δίπλα στο ναό της Αγίας Τριάδας στο Κακοδίκι Σελίνου και είναι επιμήκης καμαροσκέπαστος ναός με οξυκόρυφη καμάρα, ενισχυμένη από τρία σφενδόνια που στηρίζονται σε πεσσούς.