Ο ναός της Αγίας Παρασκευής αποτελεί μετόχι της μονής Ασωμάτων και είναι μικρός σταυροειδής ναός. Σώζεται αρκοσόλιο (ταφικό μνημείο) και μια μόνο τοιχογραφία του Χριστού που ευλογεί τους κτήτορες.

Ο ναός της Γέννησης της Θεοτόκου (8 Σεπτεμβρίου) βρίσκεται στη θέση Σόχωρα κοντά στον Μέρωνα. Ο ναός είναι γνωστός ως Παναγία η Μαυριδιανή μάλλον από το όνομα του Μαυρίκιου, ο οποίος αναφέρεται ως ιδιοκτήτης της περιοχής.

Κάτω από τον οικισμό Βρύσες Αμαρίου συναντάμε τον οικισμό φάντασμα του Σμιλέ, ο οποίος έχει εγκαταλειφθεί από τα μέσα του 20ου αιώνα. Ο οικισμός κατά την Τουρκοκρατία ήταν Τουρκοχώρι, αλλά παρόλα αυτά διατήρησε το Χριστιανικό ναό της Παναγίας, ο οποίος σώζεται έως και σήμερα σε τραγική κατάσταση.

Ο ναός της Αγίας Άννας κοντά στον Οψιγιά είναι δίκλιτος ναός (αρχικά μονόχωρος στον οποίο προστέθηκε δεύτερο κλίτος). Ο βόρειος τοίχος κατέρρευσε τον 13ο αιώνα και ξανακτίστηκε με δυτικές επιρροές. Αναστηλώθηκε το 1960.

Στο σημείο που βρισκόταν οι κατασκηνώσεις της Εκκλησίας στο Μέρωνα, μέσα σε ένα μοναδικό τοπίο με πανύψηλες βελανιδιές, υπάρχει η μικρή μονόχωρη εκκλησία του Αγίου Νικολάου και μια μικρή πηγή. Το ιερό του ναού φέρει εξαιρετικές τοιχογραφίες του 13ου αιώνα με το χαρακτηριστικό αυστηρό ύφος της εποχής.

Ο κοιμητηριακός ναός του Καλόγερου Αμαρίου είναι αφιερωμένος στην Αγία Μαρίνα και φέρει τοιχογραφίες του 1225. Παρατηρήστε τα φωτοστέφανα σε μερικές που είναι σκαλιστά στον τοίχο.

Ο ναός του Αγίου Ιωάννη του Θεολόγου βρίσκεται στην τοποθεσία Φωτί και ήταν το καθολικό μικρής μονής. Φέρει τοιχογραφίες δύο φάσεων: του 13ου αιώνα και του 14-15ου αιώνα. Ο γύρω χώρος έχει διαμορφωθεί σε παρκάκι.

Ο ναός του Μιχαήλ Αρχαγγέλου στο χωριό Μοναστηράκι βρίσκεται στην κεντρική πλατεία και είναι μονόχωρος καμαροσκέπαστος ναός του 14ου αιώνα. Στη νότια πλευρά κοσμείται με τρία τόξα, ενώ η είσοδος φέρει επάλληλα γοτθικά τόξα. Οι τοιχογραφίες της δε σώζονται σε καλή κατάσταση, παρά μόνο η αναπαράσταση της Σύλληψης της Θεοτόκου, ενώ στην καμπάνα είναι χαραγμένη η χρονολογία 1601.