Nach der Befreiung von Kreta durch Nicephorus Phocas von den Arabern im Jahre 961 n.Chr. folgte eine Zeit der kulturellen Renaissance, die sich durch die Denkmäler der Zeit widerspiegelt und die während der venezianischen Herrschaft fortgesetzt wurde.

Die meisten großen und kleinen Klöster, die heute operieren, wurden in dieser Zeit gegründet. Abgesehen von religiösen Bedürfnissen, spielten die meisten von ihnen eine wichtige Rolle bei den Kämpfen der Kreter für die Befreiung, vor allem nach der Eroberung von Kreta durch die Osmanen.

Die Kloster waren die einzigen Orte, an denen die Christen Schutz finden und ihre militärischen Operationen organisieren konnten. Verdächtig für die unterstützende Aktion der Mönche, zerstörten die Osmanen mehrere Klöster, die als revolutionäre Zentren fungierten.

Noch heute bewundern die Besucher die Geschichte des Holocaust des Arkadi-Klosters im Jahre 1866. Dann entschlossen sich die belagerten Christen, das Pulverfässer zu sprengen, um sich nicht den Osmanen zu ergeben. Alle Klöster dieser Zeit haben ähnliche Geschichten erzählt.