Die Waldlandschaft Kretas unterscheidet sich deutlich von jener des griechischen Festlands. Dichte und ausgedehnte Wälder mit klar erkennbaren Grenzen sind verhältnismäßig selten, da die Vegetation meist ein zusammenhängendes Mosaik aus Phrygana, Macchie, lockeren Baumgruppen und kleineren geschlossenen Wäldern bildet. Daher sind die Übergänge zwischen Wald, Buschland und offenen Flächen nicht immer eindeutig. Selbst die geschätzte Gesamtfläche der kretischen Wälder hängt in hohem Maß davon ab, welche Definition von Wald verwendet wird. Phrygana dominieren auf den trockensten und am stärksten beeinträchtigten Böden von der Küste bis in die Bergregionen. Auf tieferen Böden, die mehr Feuchtigkeit speichern, entwickelt sich eine dichtere Macchie. Zwischen diesen Pflanzengesellschaften wachsen Johannisbrotbäume, wilde Olivenbäume, Kermeseichen, Mastixsträucher, Erdbeerbäume, Heidekraut, sommergrüne Eichen, Zypressen, Kretische Ahorne, Steineichen und Lorbeerbäume. In Süd- und Ostkreta spielt zudem die Kalabrische Kiefer eine wichtige Rolle. Nur an einigen Stellen stehen die Bäume so dicht, dass ihre Kronen ein geschlossenes Blätterdach und damit einen wirklich schattigen Wald bilden. Anders als in vielen Teilen des griechischen Festlands lassen sich auf Kreta keine deutlich voneinander getrennten Vegetationsstufen mit immergrünen Hartlaubgewächsen in den Tieflagen, sommergrünen Eichen in mittleren Höhen und Gebirgsnadelbäumen nahe den Gipfeln erkennen. Dieses ungewöhnliche Bild ist nicht allein die Folge menschlicher Eingriffe. Es hängt auch mit der geologischen und biogeographischen Geschichte der Insel zusammen, da Kreta bereits isoliert war, bevor sich einige an kühlere Bedingungen angepasste Baumarten wie Tannen und Schwarzkiefern im Mittelmeerraum ausbreiteten. Gleichzeitig erreichten die kretischen Berge erst allmählich ihre heutige Höhe, sodass sich ursprünglich in tieferen Lagen vorkommende Arten mit der Zeit an die Bedingungen des Gebirges anpassen konnten. Die drei charakteristischsten Bäume der kretischen Bergwälder sind die Kermeseiche, die Zypresse und der Kretische Ahorn. Die Kermeseiche wächst von den Tieflagen bis zur oberen Waldgrenze und ist besonders widerstandsfähig gegenüber Beweidung. Je nach den örtlichen Bedingungen kann sie als niedriger Strauch bestehen bleiben oder sich zu einem großen Baum entwickeln. Der ausgedehnteste und bekannteste Kermeseichenwald der Insel befindet sich im Wald von Rouvas am Psiloritis, wo Kermeseichen gemeinsam mit Kretischem Ahorn, Zypressen, Steineichen und weiteren Arten wachsen. Die breitkronige Zypresse bildet eindrucksvolle Bestände in den kretischen Bergen. Der größte Zypressenwald befindet sich in den Weißen Bergen. Auf windgepeitschten Hängen nehmen die Bäume häufig ungewöhnliche, niedrige oder verdrehte Formen an. Auf den niedrigeren Hügeln von Apokoronas reichen die Zypressen dagegen fast bis in die Ebene hinab und bilden zusammen mit immergrünen Lorbeerbäumen einen dichten Wald. Bedeutende Zypressenbestände sind auch im Nationalpark der Weißen Berge, im gebirgigen Kydonia sowie im Gebiet von Kritsa und Kroustas erhalten. Der Kretische Ahorn wächst ebenfalls in der Bergzone, kommt jedoch auch in tiefer gelegenen Schluchten vor. Dies zeigt, dass die Verbreitung der kretischen Bäume keinen starren und vorhersehbaren Höhengrenzen folgt. Wälder der Kalabrischen Kiefer erstrecken sich gewöhnlich von der Küste bis in die unteren Bergregionen. An einigen Stellen steigen sie deutlich höher hinauf, etwa an den Südhängen der Weißen Berge, im Dikti-Gebirge oberhalb des Selakano-Waldes und in den Bergen von Sitia oberhalb des Thripti-Gebirges. Die Kalabrische Kiefer besiedelt leicht steinige Hänge, sandige Böden und aufgegebene Felder. Daher stellen mehrere Kiefernwälder eine sekundäre Vegetation dar, die sich nach früheren Störungen entwickelt hat. Ein charakteristisches Beispiel für diese Dynamik ist Gavdos, wo Kiefern zunächst verlassene Felder besiedelten und sich anschließend bis zur Küste ausbreiteten. Bedeutende Kiefern- und Mischwälder sind bei Kato Symi, Vorizia, Koudoumas, Prina und an den Südhängen des Asterousia-Gebirges erhalten. Diese Wälder beherbergen zahlreiche endemische und geschützte Arten, darunter die Kretische Zelkove und das Kretische Waldvöglein, und bieten vielen Tier- und Vogelarten einen wichtigen Lebensraum. Einen besonderen Charakter besitzen auch Wälder, die von weniger verbreiteten Baumarten gebildet werden. In der Nähe von Malia liegt der Azilakodasos-Wald, einer der bedeutendsten Steineichenwälder Griechenlands. Bei Tris Ekklisies ist ein seltener natürlicher Johannisbrotwald erhalten. Die Palmenhaine von Vai und Preveli bestehen überwiegend aus der heimischen Kretischen Dattelpalme, kleinere Bestände dieser Art kommen jedoch auch an weiteren Küstenabschnitten der Insel vor. Die heutige Gestalt der kretischen Wälder ist das Ergebnis eines langen Zusammenspiels von Klima, Boden, geologischer Geschichte, Konkurrenz zwischen den Pflanzen und menschlicher Tätigkeit. Beweidung, Brände, Holzeinschlag, Landwirtschaft und die Aufgabe alter Felder können den Wald einerseits zurückdrängen und andererseits die Ausbreitung bestimmter Arten begünstigen. Trotz ihrer häufig offenen und unregelmäßigen Struktur schützen die Wälder Kretas den Boden vor Erosion, speichern Wasser, beherbergen zahlreiche endemische Arten und sind ein untrennbarer Bestandteil der Natur- und Kulturlandschaft der Insel.
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