Historische Museen von Kreta bieten ein Gesamtbild der Geschichte und Kultur von Kreta und viele von ihnen beabsichtigen, den Widerstand und den Kampf der Kreter gegen die verschiedenen Besatzer von Kreta zu gedenken.
Deutsche Tunnel, Platanien 
Ein lebendiges Museum der geschichtlichen Erinnerung, das von jedem Besucher Kretas gesehen wird, der das Leiden des griechischen Volkes während der deutschen Besatzung aufzeichnet, sind die Galerien von Platanias. Der Schutzraum wurde unterhalb der Kirche von Agios Dimitrios in Pano Platanias von den beschlagnahmten Einheimischen.
Einer der Orte des Märtyrertums ist Pervolia von neun Dörfern von Kissamos, von wo aus der Häuptling von Kissamos Anagnostis Skalidis stammt, der zu Recht Karaiskakis von Kreta genannt wurde (Karaiskakis ist einer der berühmtesten Helden Griechenlands, der gegen die Türken kämpfte).
Das Museum ist eines von zwei Wachsmuseen, die in Griechenland existieren und ist eine Idee des Bildhauers Dionysis Potamianos. Es befindet sich in Zoniana, an den nördlichen Ausläufern des Psiloritis Berges.
Mournies ist der Geburtsort von Eleftherios Venizelos, dem bedeutendsten Politiker des modernen Griechenlands, und man kann das Haus besuchen, in dem er lebte, das heute als Museum dient.
Der bedeutendste griechische Politiker Eleftherios Venizelos lebte in seinem väterlichen Haus in Chalepa (Chania) seit mehr als dreißig Jahren von 1880 bis 1910 und gelegentlich von 1927 bis 1935. Er wurde besonders an diesem Haus befestigt. Das ist das Haus, wo er seine Jugend verbrachte, er heiratete und seine beiden Kinder hatte, und wo seine Frau starb.
Die Position von Meliana durch das Dorf Amiras beherbergt eines der vielen Denkmäler der deutschen Gräueltaten, die von den Kretern während des Zweiten Weltkrieges erlebt wurden, und ein kleines Museum daneben. Dies gedenkt eines der heftigsten Massaker der deutschen Besatzung in Griechenland, dem Holocaust von Viannos Bezirk.
Das Museum wird seit 1997 in der Kirche des Klosters San Salvatore untergebracht, die wahrscheinlich aus dem 15. Jahrhundert stammt, neben den Bastionen auf der Westseite der venezianischen Befestigungen von Chania.
Das Museum der byzantinischen Ikonen und Relikte der Erzdiözese Kreta liegt in der venezianischen Kirche der Hl. Katharina von Sinai, im Zentrum von Heraklion und neben der Kathedrale von Hl. Minas.
