Historische Museen von Kreta bieten ein Gesamtbild der Geschichte und Kultur von Kreta und viele von ihnen beabsichtigen, den Widerstand und den Kampf der Kreter gegen die verschiedenen Besatzer von Kreta zu gedenken.
Archäologische Sammlung von Myrtos 
Die Archäologische und Folklore-Sammlung von Myrtos arbeitet seit 2001 und beherbergt hauptsächlich die Sammlung von George Dimitrianakis. Die archäologische Ausstellung umfasst einige der Ergebnisse der archäologischen Stätten von Pirgos, Fournou Korifi, aber auch einige andere Orte der Region.
Rethymnon Kriegsmuseum 
Die Sammlung des Militärmuseums von Rethymnon im Dorf Chromonastiri umfasst Militäruniformen, Waffen verschiedener Epochen in der griechischen Geschichte, Medaillen, historische Reliquien seit 1821 und später eine Ausstellung, die dem mazedonischen Kampf, der Bibliothek und den Tagungsräumen gewidmet wird.
Die Geschichte der Beerdigung ist ein ganz besonderer Ort in der Stadt Heraklion. Es wird in dem zweistöckigen Beinhaus des alten Friedhofs der Heiligen Konstantin und Helen in Heraklion untergebracht, das 1890 erbaut wurde.
Das historische Archiv von Kreta wurde 1920 in Chania gegründet und operierte bis 1928 informell, als es als öffentliche Einheit anerkannt wurde. Seit 1943 ist es ein öffentlicher Dienst und arbeitet als Anhang zum Generalstaatsarchiv. Seine Sammlung zählt rund 700.000 historische Dokumente und Manuskripte, von 1821 bis heute.
Das Historische und Folklore-Museum von Rethymnon wurde 1974 gegründet und befindet sich in einem venezianischen Gebäude (17. Jahrhundert), ein wunderbares Beispiel für die städtische Residenz der letzten Phase der venezianischen Besetzung von Kreta, in der Renaissance.
Das Museum wurde 1968 gegründet und wurde im September 1993 offiziell eröffnet. Es befindet sich in einem Gebäude, das ein typisches Beispiel der lokalen Architektur ist und auf zwei Etagen untergebracht wird: im Erdgeschoss mit Balkon, Innenhof, das ist ein gewölbtes Haus mit Nebenräumen und Mezzaninen.
Das historische Dorf von Therisso war ein Sitz der kretischen Rebellen im Jahre 1905, unter Eleftherios Venizelos, dem wichtigsten Politiker des modernen Griechenlands. Das Historische und Folklore-Museum von Theriso wird in dem Gebäude untergebracht, das als Hauptsitz von Eleftherios Venizelos während der Bewegung von Theriso (1905) diente.
Das Historische Museum von Kreta wurde 1953 von der Gesellschaft der kretischen Historischen Studien gegründet. Es wird in einem wunderschönen neoklassizistischen Gebäude untergebracht, das die Heimat von Minos Kalokerinos und der Höflichkeit des Kalokerinos Familieninstituts war.
