Kreta wird vom restlichen Festland Europas, Asiens und Afrikas isoliert, was sich in der genetischen Vielfalt der Fauna stark widerspiegelt. Von dem stolzen kretischen Steinbock, dem Luchs und der stacheligen Maus bis zu den endemischen Arthropoden und Fledermäusen von Kreta, hält die Fauna von Kreta viele Geheimnisse über die Evolution der Arten.
Es gibt keine gefährlichen Säugetiere für Menschen auf Kreta, im Gegensatz zu anderen Orten Griechenlands. Tatsächlich haben die alten Griechen diesen Mangel an großen Säugetieren wie Bären, Wölfen, Schakalen und giftigen Schlangen zugeschrieben, auf die Arbeit des Herkules (der den kretischen Stier lebendig in den Peloponnes brachte), der den Geburtsort des Zeus ehren wollte, indem er alle "schädlichen" und "giftigen" Tiere entfernte. Später glaubten die Kreter, dass die Insel von dem Apostel Paulus, der zwei Jahre lang auf Kreta lebte, mit den Exorzismen und Segnungen geräumt wurde.
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Zwergwiesel 
Der kretische Zwergwiesel (Mustela nivalis galinthias) ist eine endemische Unterart des gemeinsamen Wiesels, die auf der ganzen Insel zu finden ist. Andere Namen des Tieres sind Zwerg, Pygmy oder Mauswiesel. Kretaner nennen ihn auch kalogiannou oder kalogynekari (d.h. Nonne), wegen seiner weiß gestreiften Brust, so dass er wie eine Nonne aussieht.
Der kretische Jagdhund oder der kretische Erforscher ist der älteste Jagdhund von Hunden in Europa mit mehr als 4000 Jahren der Geschichte auf der Insel Kreta. Es wird geglaubt, dass er aus der alten Hunderasse des Hügels Basentzi in Ägypten stammt und zu den besonderen Bedingungen der Insel eingeführt wurde.
Die kretische Crocidurinae (wiss. Crocidura zimmermanni) ist das einzige endemische Säugetier in Griechenland, das nur in Kreta lebt, aber es wird durch die eingeführte weiß-verzahnte Spitzmaus (wiss. Crocidura suaveolens) verschoben. Darüber hinaus wurde das kleinste Säugetier der Welt, die Etruskerspitzmaus ist die dritte Art von Spitzmaus auf Kreta, getroffen.
Die essbare Dormouse (Glis glis argenteus), Eichhörnchen angebundene Dormouse, Myoxus oder Fett Dormouse von Kreta ist eine Unterart der gemeinsamen Dormouse Arten, die in ganz Europa und Westasien getroffen werden. Kreta ist der südlichste Punkt, wo wir diese Art treffen, wobei die größte Bevölkerung im Samaria Nationalpark begrenzt wird und einige Einzelarten im Psiloritis Berg gemeldet werden.
Das europäische Kaninchen (Oryctolagus cuniculus) ist eine eng verwandte Art zu Hasen, die auf der Insel Kreta von Menschen eingeführt wurde (viele verwirren das mit Hasen). Trotz der vielen Raubtiere auf Kreta paart das Kaninchen schnell und lebt nun über die ganze Insel Kreta und in mehreren kleineren Inselchen um sie herum. Aus diesem Grund haben die Behörden mehrmals versucht, ihre Bevölkerung zu senken.
Die kretische stachelige Maus (Acomys minous) ist eine bedrohte Art von Maus, endemisch auf Kreta und Afrika. Sie wird so nach den groben, steifen Haaren auf dem Rücken und auf dem Schwanz genannt.
Der Hase (Lepus europaeus) ist eines der am weitesten verbreiteten Säugetiere in ganz Europa, das auch in großer Zahl auf der ganzen Insel Kreta existiert. Es ist ein pflanzenfressender Säugetier, dessen Länge 55 Zentimeter erreichen kann und dessen Gewicht etwa 2-3 Kilo beträgt. Seine Farbe ist haselnussgrau bis grau braun.
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