С прибытием на Крит Иоанна Отшельника начало развиваться мощное направление аскетизма, которое сохраняется и по сей день. Сотни отшельников стали уединяться в отдаленных уголках острова и сформировали целые аскетические сообщества, которые позже превратились в процветающие монастыри.
Особым примером отшельничества служит католический монастырь на мысе Акротири, где монахи живут в пещерах и выполняют свое служение вдали от мирских удовольствий. Также важную роль сыграли религиозные общины на уединенных полуостровах Грамвуса и Родопу, где работало несколько небольших монастырей.
Важнейшим обиталищем отшельников стали естественным образом изолированные непроходимые горы Астерусия к югу от Ираклиона. В сотнях пещер между Агиос Никитас и мысом Литино до сих пор живут отшельники. Они практически не общаются друг с другом. Отшельники районов Агиофараго и Марцало собираются раз в год в пещере Гуменоспилиос, чтобы выяснить, кто пережил этот год.
На востоке Крита в северной провинции Мирабелло находится крупнейший район обитания аскетов, где возведены десятки небольших монастырских строений. Здесь отшельники строят крошечные монастыри, где обычно живут в одиночку.
Церковь Св. Иоанна, Лиопетро 
Под вершиной Лиопетро находится очень старая церковь Св. Иоанна, которая также была в свое время монастырем. Добраться сюда можно по очень плохой дороге, начинающейся у главной дороги между Лассити и Ситией (вначале дорога зацементированная). Задний фон у возвышающихся камней Лиопетро очень впечатляющий.
Интересный монастырский комплекс, большая часть которого разрушена. Кафоликон находится в хорошем состоянии. Принадлежит типу однонефных сводчатых храмов с двумя поперечными подпружными арками.
Сегодня заброшенный монастырь Св. Онуфрия построен на крутом овраге с вертикальными утесами, рядом с ручьем с холодной водой. Вокруг пещеристой церкви виднеются покинутые монашьи кельи.
Монастырь Святого Иоанна в Вулгарис сегодня пустует и только церковь Св. Иоанна Крестителя (его День празднуется 24 июня) и следы нескольких келий уцелели. Монастырь, возможно, работал с XV века и вскоре очень разбогател (благодаря тысячам оливковых деревьев, растущих на его территории).
Церковь Св. Георгия в Финокалис был храмом при женском монастыре, основанном в XIV веке, который прекратил работу в 1980-х. Впечатляет наклон стен храма, которые завалились бы при оползне, если бы не были подперты. Церковь украшена ценными фресками XIV века.
Основан монастырь предположительно в 14 или 15 веках. Находится в 27 км от города Рефемно, между деревнями Волионес, Панданаса и Апостоли на юго-востоке от Рефемно, в 8 км от деревни Амари.
Среди теплиц долины Франгокастелло над пляжем Орти Аммос нашли заброшенный маленький монастырь Святого Харлампия. Говорят, что в 1821 году здесь поселились монахи Григорий и Магдалина, хотя считается, что сам монастырь намного старше.
