С прибытием на Крит Иоанна Отшельника начало развиваться мощное направление аскетизма, которое сохраняется и по сей день. Сотни отшельников стали уединяться в отдаленных уголках острова и сформировали целые аскетические сообщества, которые позже превратились в процветающие монастыри.
Особым примером отшельничества служит католический монастырь на мысе Акротири, где монахи живут в пещерах и выполняют свое служение вдали от мирских удовольствий. Также важную роль сыграли религиозные общины на уединенных полуостровах Грамвуса и Родопу, где работало несколько небольших монастырей.
Важнейшим обиталищем отшельников стали естественным образом изолированные непроходимые горы Астерусия к югу от Ираклиона. В сотнях пещер между Агиос Никитас и мысом Литино до сих пор живут отшельники. Они практически не общаются друг с другом. Отшельники районов Агиофараго и Марцало собираются раз в год в пещере Гуменоспилиос, чтобы выяснить, кто пережил этот год.
На востоке Крита в северной провинции Мирабелло находится крупнейший район обитания аскетов, где возведены десятки небольших монастырских строений. Здесь отшельники строят крошечные монастыри, где обычно живут в одиночку.
Храм Преображения Господня, Неаполис 
К северу от Неаполиса находится современная двухнефная кладбищенская церковь, один неф которой посвящен Преображению Господню, другой – Всем Святым.
Относительно недалеко к западу от Неаполиса когда-то располагался принадлежавший Францисканскому ордену так называемый монастырь Фраро, или Святого Антония Симети, римско-католического толка.
Монастырь Святого Георгия Врахасоти, по всей видимости, был основан в византийский период и достиг своего расцвета при венецианцах, когда даже игумен избирался их наместником на Крите (Пападаки, 1986, с. 115). В годы оттоманского господства принимал активное участие в восстаниях против турок. Сегодня монастырь не является действующим.
Церковь Преображения Господня, или Господа Иисуса Христа, находится в Ниспите, на склоне долины Мирабелло, к юго-западу от Неаполиса. В этом месте в годы венецианского господства находился монастырь, принадлежащий области Неаполис – Кенурио Хорио.
Заброшенный монастырь Св. Иоанна Крестителя (День которого отмечается 29 августа) расположен в Скурас над лагуной Элунда. Храм был отреставрирован и представляет собой арочную базилику с единственным проходом рядом с руинами монашьих келий, водяным резервуаром и двухэтажным зданием XIX века с конюшней на первом этаже. Фундамент монастыря расположен до 1575. В 1617 он попал под покровительство близлежащего монастыря Арети.
У покинутого поселка Фратиас у позиции Онтадес или Эхо Фратиас, мы находим церковь Св. Иоанна. Многочисленные здания вокруг нее указывают на то, что раньше церковь была частью монастыря. Нынешняя церковь была построена в 1990-х на месте разрушенной церкви и посвящена Св. Иоанну.
У заброшенного поселка Фратиас, рядом с монастырем Хера Хила находится церковь Св. Иоанна, которая была когда-то храмом маленького монастыря. В этой арочной церкви только один неф, а у входа указана дата 1590.
Вокруг монастыря сохранилось несколько разрушенных зданий и келий.
Монастырь святого Георгия Ксирон Ксилон закрыт, находится в ведении Архиологии, Византийского отдела. Сохранился один документ датируемый 10 мартом 1689 г. В котором говорится, что монастырь основан монахом Афанасием сын Георгия, как отшельничиский скит, чтоб уйти от неверных, наверно подразумевает турков.
