Heraklion beherbergt viele Schluchten, von denen die meisten die Bereiche von Psiloritis und Asterousia kreuzen. Asterousia hat wunderbare Wanderschluchten, die wichtigsten sind Agiofarago, Martsalo und Trafoulas. Allerdings ist die berühmteste Schlucht Gafaris bei Psiloritis. Sie überquert das herrliche Eichenholz von Rouvas. Andere Schluchten von Psiloritis sind die Schlucht von Kroussonas, durch die der minoische Weg zur Idaeischen Höhle führt, die Schlucht Vromonero, die Schlucht Vorizano und die beiden kleinen Schluchten von Asites (Saint Charalambos und Saint Anthony). In der Nähe von Heraklion Stadt gibt es die üppigen Schluchten von Karteros, Kounavi, Sylamos, Almyros und Venerato. Die westlichen Hänge des Lassithi-Gebirges beherbergen die Schluchten von Roza, Ambelos, Apotyposi und den Fluss Aposelemis von Hersonissos.
Abgesehen von erreichbaren Schluchten, ist Heraklion die Heimat von einigen sehr beliebten technischen Schluchten wie die imposante Schlucht von Arvi, die nach einem 80m hohen Fall zu einem dunklen unterirdischen Fluss wird. Besonders das Gebiet von Tsoutsouras und Keratokambos ist die Heimat von vielen steilen Schluchten, die mit Schrauben und Anker ausgestattet wurden.
Spiliotissa Schlucht, Rogdia 
Im Westen des Dorfes Rogdia wurde eine kleine Schlucht gebildet, die in die Gegend von Paliokastro führt. Der Weg beginnt von der alten Wassermühle von Koukos, durch die Hauptstraße, die Rogdia mit Achlada verbindet, und steigt bis zum eindrucksvollsten Teil, dem 10 Meter hohen Wasserfall Rechtra, der über einen ziemlich steilen Abhang mit Seilen erreicht wird.
Die Schlucht von Embasa beginnt vom Dorf Kato Kera und endet in der Nähe des Dorfes Gonies, etwa 2 km lang. Ihr oberer Teil ist sehr steil und im Winter werden mehrere Wasserfälle gebildet, mit dem höchsten Wasserfall etwa 20m hoch.
Östlich von Voriza Dorf, am Fuße von Psiloritis, beginnt eine trockene Schlucht mit Stechpalmen, die auf die Hochebene des Nida Plateau und in die Höhle Ideon Antron führt. Die Schlucht ist anfangs sehr steil mit kleinen Wasserfällen, die aus den steilen Kalksteinklippen stammen, aber bald verwandelt sie sich in ein schönes Tal mit Kermes Eichen und einer reichhaltigen Flora mit vielen endemischen Pflanzen Kretas wie dem kretischen Dittany oder "erontas" (Origanum Dictamnus), oder der Rock Lettuce (Petromarula pinnata).
Die Schlucht von Agia Anastasia beginnt von Kenourgio Horio, der Provinz Pediada (Höhe 160m) und endet an der Seesiedlung von Gournes. Der Name wurde nach der höhlenartigen Kapelle von St. Anastasia genommen, in der Nähe von ihrem Eingang. Die Vegetation beschränkt sich auf Oleander und die Wände werden in mehreren Punkten eng. Der Abstieg der Schlucht dauert etwa drei Stunden.
Die Schlucht von Ambelos liegt südöstlich von Gonies Dorf (Hersonissos Gemeinde), nur etwa 1 km von den südlichen Grenzen des Dorfes. Der Ansatz ist einfach von der Landstraße, die durch die Schlucht, entlang des Bettes eines Nebenflusses des Aposelemis Flusses läuft.
Die wilde und imposante Schlucht, auch bekannt als Gerontzou beginnt von dem Tal von Pervola in der Nähe des Tals Mournia, Range Asteroussia, und endet am schönen Strand von Kaminaki. Die Länge der Schlucht erreicht 3,5-4 km und während der Route treffen wir schroffe und schmale Passagen, Wasserfälle (mit Wasser nur im Winter) und seltene Felsformationen, vorwiegend aus rötlichem Kalkstein. Die Route im Schluchtbett ist ohne die Verwendung von Seilen möglich, aber an einigen Stellen müssen wir etwas höher steigen, um die steilen Wasserfälle zu vermeiden.
Die Schlucht von Eligia oder Valahas wird südlich von Heraklion gebildet und der Strand Elygia wird an ihrem Ausgang gebildet. Der höchste Rappel ist etwa 60m hoch und 4 Stunden sind für seine Kreuzung erforderlich (nur mit der Schluchtausrüstung). Der untere Teil der Schlucht wird von Pinien bedeckt.
Nur wenige Meter westlich der Tsoutsouras Schlucht bildet sich die sehr enge und kleinere Schlucht von Troulla. Da sie kürzer als die Tsoutsouros Schlucht ist, hat sie die Aufmerksamkeit der Besucher und ist sehr beeindruckend mit mehr als 15 schönen Wasserfällen entlang ihres Bettes, der größte Wasserfall ist 15m hoch.
